전날 대검찰청 국정감사에서 윤석열 총장은 ‘이명박·박근혜·문재인 정부 중 어느 정부가 그나마 중립적입니까? 중립을 보장하고 있습니까?’라는 이철희 더불어민주당 의원 질의에 “이명박 정부 때 쿨하게 처리했던 기억이 난다”고 답변했다. 이를 두고 진보 진영에서는 현 정부에 대한 불만을 우회적으로 드러냈다며 논란이 불거졌다.
그러나 대검찰청은 이날 “검찰총장은 과거 본인이 검사로서 직접 처리한 사건을 예로 들며, 이명박 정부에서부터 현 정부에 이르기까지 순차적으로 검찰 수사 과정의 경험 및 소회를 답변하려 했다”고 강조했다. 대검은 “특히 현 정부에서는 과거와 달리 법무부에 처리 예정 보고를 하지 않고, 청와대에서 검찰의 구체적 사건 처리에 관해 일체 지시하거나 개입하지 않는다는 점을 설명하려 했으나, 해당 의원이 답변 도중 다른 질의를 이어감에 따라 답변이 중단됐다”고 해명했다.